邢云飞是顺天府人，最爱收集奇石，见到好石头花再多钱也舍得。那年春水初涨，他在河边打鱼，忽然渔网一沉，捞上来一看，竟是个一尺见方的玲珑石头，山峦起伏，美不胜收。老邢乐得直搓手，像捡了天大的宝贝。
回家后，他特意雕了紫檀木底座，把石头供在书案上。这石头也神奇，每逢阴天，每个孔洞里都会冒出云雾，远远望去像塞着团团新棉花。
有个恶霸听说这事，带着家丁闯进门来。那厮抓起石头扔给随从，翻身上马就跑。老邢气得直跺脚，可又无可奈何。谁知家丁背着石头过桥时，手一滑，石头扑通掉进了河里。恶霸抡起鞭子抽得家丁皮开肉绽，又花钱雇来水性好的，在河里摸了好几天，连影子都没找着。最后只好贴出悬赏告示走了。
打那以后，河边天天挤满找石头的人。直到秋叶泛黄时，老邢又来到当初掉石头的地方，望着河水发呆。忽然发现水底有个熟悉的身影——那石头竟好端端躺在河床上！他连衣裳都顾不上脱，扑通跳进水里把石头抱了上来。
这回他学乖了，把石头供在内室，轻易不让人看。谁知有天来了个白胡子老头，进门就说要看看石头。老邢推说早丢了，老头指着厢房笑："那不是吗？"老邢心里咯噔一下，硬着头皮带老头进屋，果然看见石头摆在桌上！
老头摸着石头说："这是我家的旧物，丢了很久，今天总算找到了。"老邢急得脸红脖子粗，两人争得不可开交。老头突然问："既然是你的，可有什么凭证？"见老邢答不上来，老头掰着指头说："这石头前后九十二个孔，最中间的孔里还刻着'清虚天石供'五个字。"
老邢凑近一看，孔里果然有米粒大的小字，数数孔洞，分毫不差。老头作揖要走，老邢追出门外，一回头发现石头不见了。他拼命追上老头，拽着袖子哀求。老头叹道："这石头与你有缘，但它命中还有一劫。你若非要留下，得折三年阳寿，愿意吗？"老邢咬牙点头。只见老头手指一点，三个石孔就像捏面团似的合上了："这些孔就是你的寿数啊。"说完化作清风不见了。
转眼过了一年多，有天老邢出门，夜里遭了贼。别的都没丢，唯独那石头不见了。他急得差点上吊，四处打听也没消息。直到三年后的庙会上，他忽然在卖石头的摊子上看见了宝贝！两人争执不下闹到衙门。卖石头的只知道孔洞数量，老邢却连指痕和暗字都说得清清楚楚，终于物归原主。
后来有个尚书想强买，老邢宁死不从。尚书使坏把他关进大牢，他妻子儿子偷偷把石头献了出去。老邢出狱后气得要寻死，夜里却梦见个自称"石清虚"的男子，告诉他明年八月二十日去海岱门，花两贯钱就能赎回来。果然第二年尚书获罪死了，石头被家丁偷出来卖，正让老邢碰上。
老邢活到八十九岁，临终嘱咐儿子一定要让石头陪葬。半年后盗墓贼挖走了石头，可没几天，两个贼人在路上突然对着空气磕头求饶："邢老爷饶命！我们这就把石头送回去！"后来石头在公堂上突然碎裂，老邢的儿子把碎片重新埋进坟里。
这石头啊，从河里到案头，从牢狱到坟墓，跟老邢纠缠了一辈子。都说玩物丧志，可老邢和这石头，倒像是前世修来的缘分。石头尚且如此重情义，何况是人呢？
邢云飞，顺天人。好石，见佳不惜重直。偶渔于河，有物挂网，沉而取之，则石径尺，四面玲珑，峰峦叠秀。喜极如获异珍。既归，雕紫檀为座，供诸案头。每值天欲雨，则孔孔生云，遥望如塞新絮。
有势豪某踵门求观。既见，举付健仆，策马径去。邢无奈，顿足悲愤而已。仆负石至河滨，息肩桥上，忽失手堕诸河。豪怒，鞭仆。即出金雇善泅者，百计冥搜，竟不可见。乃悬金署约而去。由是寻石者日盈于河，迄无获者。后邢至落石处，临流於邑，但见河水清澈，则石固在水中。邢大喜，解衣入水，抱之而出。携归，不敢设诸厅所，洁治内室供之。一日有老叟款门而请，邢托言石失已久。叟笑曰：“客舍非耶？”邢便请入舍以实其无，及入，则石果陈几上。愕不能言。叟抚石曰：“此吾家故物，失去已久，今固在此耶。既见之，请即赐还。”邢窘甚，遂与争作石主。叟笑曰：“既汝家物，有何验证？”邢不能答。叟曰：“仆则故识之。前后九十二窍，孔中五字云：‘清虚天石供。’”邢审视，孔中果有小字，细如粟米，竭目力才可辨认；又数其窍，果如所言。邢无以对，但执不与。叟笑曰：“谁家物而凭君作主耶！”拱手而出。邢送至门外；既还，已失石所在。邢急追叟，则叟缓步未远。奔牵其袂而哀之。叟曰：“奇哉！经尺之石，岂可以手握袂藏者耶？”邢知其神，强曳之归，长跽请之。叟乃曰：“石果君家者耶、仆家者耶？”答曰：“诚属君家，但求割爱耳。”叟曰：“既然，石固在是。”入室，则石已在故处。叟曰：“天下之宝，当与爱惜之人。此石能自择主，仆亦喜之。然彼急于自见，其出也早，则魔劫未除。实将携去，待三年后始以奉赠。既欲留之，当减三年寿数，乃可与君相终始。君愿之乎？”曰：“愿。”叟乃以两指捏一窍，窍软如泥，随手而闭。闭三窍，已，曰：“石上窍数，即君寿也。”作别欲去。邢苦留之，辞甚坚；问其姓字亦不言，遂去。
积年余，邢以故他出，夜有贼入室，诸无所失，惟窃石而去。邢归，悼丧欲死。访察购求，全无踪迹。积有数年，偶入报国寺，见卖石者，则故物也，将便认取。卖者不服，因负石至官。官问：“何所质验？”卖石者能言窍数。邢问其他，则茫然矣。邢乃言窍中五字及三指痕，理遂得伸。官欲杖责卖石者，卖石者自言以二十金买诸市，遂释之。
邢得石归，裹以锦，藏椟中，时出一赏，先焚异香而后出之。有尚书某购以百金，邢曰：“虽万金不易也。”尚书怒，阴以他事中伤之。邢被收，典质田产。尚书托他人风示其子。子告邢，邢愿以死殉石。妻窃与子谋，献石尚书家。邢出狱始知，骂妻殴子，屡欲自经，皆以家人觉救得不死。夜梦一丈夫来，自言：“石清虚。”戒邢勿戚：“特与君年余别耳。明年八月二十日昧爽时，可诣海岱门以两贯相赎。”邢得梦，喜，谨志其日。其石在尚书家，更无出云之异，久亦不甚贵重之。明年，尚书以罪削职，寻死，邢如期至海岱门，则其家人窃石出售，因以两贯市归。
后邢至八十九岁，自治葬具，又嘱子必以石殉，及卒，子遵遗教，瘗石墓中。半年许，贼发墓劫石去。子知之，莫可追诘。越二三日，同仆在道，忽见两人奔踬汗流，望空投拜，曰：“邢先生，勿相逼！我二人将石去，不过卖四两银耳。”遂絷送到官，一讯即伏。问石，则鬻宫氏。取石至，官爱玩欲得之，命寄诸库。吏举石，石忽堕地，碎为数十余片。皆失色。官乃重械两盗论死。邢子拾碎石出，仍瘗墓中。
异史氏曰：“物之尤者祸之府。至欲以身殉石亦痴甚矣！而卒之石与人相终始，谁谓石无情哉？古语云：‘士为知己者死。’非过也！石犹如此，何况于人！”